Історія розвитку школи сягає у далекі 70-ті роки. У 1970 році відбулося об'єднання дитячо-юнацьких команд МІСЬКВНО-2 та двох дорослих команд Колективу фізичної культури "Київського м'ясокомбінату", що у Дарницькому районі м. Києва. Це об`єднання і дало назву клубу - "Дружба".
У 1977 році для клубу "Дружба" збудовано спорткомплекс з ігровим залом 36 х 18 та футбольне поле з зеленим газоном.
У 1986 році директором спорткомплексу були запрошені у колектив спорткомплексу на посади тренерів з футболу колишні вихованці школи Філенко Е.В. та Нахабов С.В.,.і вже у 1988 році клуб "Дружба" виставляє в першості Києва команди всіх вікових груп.
14 квітня 2003 року наказом Головного управління по фізичній культурі та спорту за №352 працівники клубу "Дружба" переходять до ДЮСШ "Атлет", утворивши єдину структуру - Спортивну дитячо-юнацьку школу олімпійського резерву "Атлет". У цьому ж році СДЮШОР "Атлет" передаються спортивні комплекси по вул. Тростянецька, 60 та по вул. Зрошувальна, 4-А.
На сьогоднішній день ДЮСШ "Атлет" є відомою у всій країні та за її межами футбольною школою, команди якої є багатократними переможцями та призерами міських, загальнодержавних і міжнародних змагань. У музеї школи можна побачити величезну кількість різних кубків та нагород за здобуті перемоги. Тренери школи є висококласними фахівцями, що постійно вдосконалюють свій фаховий рівень, в тому числі при обміні досвідом з зарубіжними колегами.
01 квітня 2015 року ДЮСШ «Атлет» стає школою вищої категорії.
В школі займаються 1095 вихованців, це 38 команд. Команди школи приймають участь у чемпіонаті м. Києва та 4 команди приймають участь в ДЮФЛ України.
В ДЮСШ «Атлет» працюють 19 тренерів.
Спортспоруди ДЮСШ «Атлет»: 02099 м. Київ, Дарницький район, вулиця Зрошувальна, 4-А ( 1. спортивний зал 36х18, 2. футбольний майданчик 20х40 (покриття – штучна трава), 3. футбольне поле 103х68 (покриття – штучна трава), 4. критий футбольний майданчик (манеж) 50х30 (покриття – штучна трава)
Випускники ДЮСШ «Атлет» виступали за :
- національну збірну України: Кучер Олександр, Пілявський Андрій та Андрієвський Олександр.
- молодіжні юнацькі збірні України: Гребенюк І., Ледньов Б. та Луканов Д.
За останні роки перейшли в професійні клуби більше 40 випускників ДЮСШ «Атлет».
Клубний залік м. Києва з футболу:
2010 рік 1 місце – ДЮСШ «Атлет»
2011 рік 1 місце – ДЮСШ «Атлет»
2012 рік 2 місце – ДЮСШ «Атлет»
2013 рік 2 місце – ДЮСШ «Атлет»
2014 рік 2 місце – ДЮСШ «Атлет»
2015 рік 2 місце – ДЮСШ «Атлет»
2016 рік 5 місце – ДЮСШ «Атлет»
2017 рік (перехідна) 4 місце –ДЮСШ «Атлет»
2017-2018 рр. 2 місце -- ДЮСШ «Атлет»
2018 -2019 рр. 1 місце -- ДЮСШ «Атлет»
2019 -2020 рр. 4 місце -- ДЮСШ «Атлет»
2020 -2021 рр. 3 місце -- ДЮСШ «Атлет»
2021 -2022 рр. 1 місце -- ДЮСШ «Атлет»
2022 -2023 рр. 1 місце -- ДЮСШ «Атлет»
